Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms