Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PXDC1Q5TGL8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PXDC1Q5TGL8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms