Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PRPF4BQ13523 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms