Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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