Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TP53BP1Q12888 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms