Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms