Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI2P48788 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms