Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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