Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms