Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCC1P18754 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCC1P18754 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms