Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MCF2P10911 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MCF2P10911 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MCF2P10911 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms