Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNKO75909 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCNKO75909 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms