Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3KR12 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3KR12 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3KR12 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3KR12 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms