Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL33A6NCF5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL33A6NCF5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms