Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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