Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms