Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PHF12Q96QT6 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms