Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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