Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATP6AP1Q15904 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATP6AP1Q15904 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms