Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIP4Q15650 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIP4Q15650 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms