Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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