Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCOLCEQ15113 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCOLCEQ15113 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms