Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNX17Q15036 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms