Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms