Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms