Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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