Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TOP3AQ13472 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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