Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CALCOCO2Q13137 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms