Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECH1Q13011 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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