Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PGGT1BP53609 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
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PGGT1BP53609 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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