Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD10P28358 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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