Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRCP08575 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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PTPRCP08575 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PTPRCP08575 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRCP08575 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRCP08575 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRCP08575 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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