Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCEO43556 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCEO43556 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCEO43556 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCEO43556 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCEO43556 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SGCEO43556 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCEO43556 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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