Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms