Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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COPS7AQ9UBW8 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
COPS7AQ9UBW8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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