Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF7Q9UBF6 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF7Q9UBF6 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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