Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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LHX9Q9NQ69 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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LHX9Q9NQ69 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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LHX9Q9NQ69 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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LHX9Q9NQ69 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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LHX9Q9NQ69 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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