Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
C15orf40Q8WUR7 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
C15orf40Q8WUR7 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
C15orf40Q8WUR7 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
C15orf40Q8WUR7 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
C15orf40Q8WUR7 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
C15orf40Q8WUR7 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
C15orf40Q8WUR7 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms