Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDKN3Q16667 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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