Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CTF1Q16619 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CTF1Q16619 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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