Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms