Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CCDC85BQ15834 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms