Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
COL19A1Q14993 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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COL19A1Q14993 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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COL19A1Q14993 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL19A1Q14993 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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