Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
ERV3-1Q14264 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ERV3-1Q14264 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms