Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CKAP5Q14008 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms