Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GTF2H2Q13888 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms