Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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