Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PEX6Q13608 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PEX6Q13608 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms