Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATRQ13535 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATRQ13535 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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