Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
LSAMPQ13449 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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